海军省是1872年至1945年间主管大日本帝国海军事务的内阁部门，相当于各国海军部。

1872年（明治5年）2月，海军省根据太政官第62号公告从兵部省独立出来。当时军政与军令并未明确分开。大日本帝国宪法实行后，军令由作为大日本帝国陆海军大元帅的天皇通过直属机构主管，海军省内主管军令的部分被参谋本部吸收，1893年（明治26年），设置了海军军令部作为海军的最高军令机关。海军省成为主管海军政策、军备、人事、教育等事务的机关，以军务局（日语：軍務局）为中心。

海军省是日本内阁中的一个省，首长为由天皇任命的海军大臣。海军大臣的职责是海军的军政管理，不具有军令权，由现役的海军大将或中将担任。当逢海军裁军会议等事务，海军大臣需要长期离开国内时，设置由内阁总理大臣兼任的临时海军大臣。

1945年（昭和20年）11月30日，海军省根据第680号敕令而废除，改为第二复员省（日语：第二復員省）。第二复员省于1946年（昭和21年）6月被废除，原海军省的财产全部被大藏省（现在的财务省）处理。海军省资料的一部分被防卫省和厚生劳动省继承。

海军省的建筑物在东京都千代田区霞关。由英国建筑师约西亚·康德尔设计，于1894年完成。在二战中受到损坏。战后，至1985年完全被拆除。原址上现在为农林水产省本部办公楼（中央联合办公楼第1号馆）。

直接隶属于海军大臣的机构。