高仲源（1935年8月15日－），中华民国空军中将，山东昌荣人,为中华民国国军留美将领之一，曾任第五届立法委员，现任中华民国退伍军人协会理事长。

高仲源毕业于空军军官学校飞行第37期、三军大学空军学院63年班，随后赴美国进修，毕业于美国空军仪器飞行学校教官班。曾任国防部驻南非共和国武官、空军第439联队联队长、空军总部政战主任、联勤副总司令、行政院国军退除役官兵辅导委员会主任秘书、行政院国军退除役官兵辅导委员会常务副主任委员、荣民荣眷基金会董事长等职务。高仲源虽未于2001年中华民国立法委员选举当选，然因中国国民党当选人陈建年于就职前即获任命为张俊雄内阁的原住民族委员会主任委员并放弃党籍，故高于就职日前即递补当选为第五届立法委员。