约翰·马吉（John Magee，1884年－1953年），籍贯宾州匹兹堡，美国传教士，以在南京大屠杀期间救助中国平民而著名。

1912年至1940年5月，马吉在南京下关挹江门外的道胜堂教堂传教。南京大屠杀期间，马吉牧师担任国际红十字会南京委员会主席以及南京安全区国际委员会委员。马吉牧师曾参与救助中国难民，并拍摄了日本军人屠杀中国人的纪录片。1946年，马吉牧师曾经在日本东京设立的远东国际军事法庭上为日军南京大屠杀作证，称“日军到处杀害中国人”，但是当被问及“是你亲眼看到的吗？”时，马吉牧师回答称：“我亲眼看见的只有一起”。马吉牧师称该起日军射杀中国人事件发生在1937年12月17日，当时他在自家的阳台上看见一名中国人被日本兵杀害，马吉牧师描述的整个事件经过是一名中国人向一名日本兵做了什么之后忽然逃走，日本兵追上去后将其射杀。马吉牧师所称的该起事件在其日记中虽然也有提及，但是日记中马吉牧师明确表示“我并没有真正看到杀害现场”。

2000年8月2日，南京市下关区政府将马吉牧师曾经传教的道胜堂教堂（今南京市第十二中学图书馆）命名为约翰·马吉图书馆。