六合境清水寺位于台湾台南市中西区的开山路三巷10号，是一座供奉观世音菩萨及清水祖师的佛寺。六合境清水寺创建于清康熙23~61年之间（1684~1722），主祀观世音菩萨，配祀清水祖师。

六合境清水寺原奉祀清水祖师，寺前围沟仔底，某次大雨后，漂流一块柴木，里人拾取雕刻观世音金身供俸，称‘水流观音’，并改主祀观音佛祖，同祀清水祖师。昔日被誉为府城七寺八庙之一，为府城重要佛寺。庙内留存光绪2年(1876年)‘流水前身’及光绪11年(1885年)‘大观在上’二方古匾，寺前左右两侧有两棵百年榕树，目前由台南市政府列为珍贵自然资源，还有一个百年泵，目前仍可使用。2011年六合境清水寺重修完成。

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