马匹毛色（Equine coat color）为马匹毛发身上呈现的颜色，现有已定义的毛色有十多种，如包括未定义的毛色，会超过一百种。而其中黑色、枣色、棕色、栗色或灰色为主要的马匹毛色。

在马匹的毛色上不同的显性基因MC1R, KIT, STX17，及稀释基因 ASIP, MATP, DUN 将毛色产生不同变化的毛色。这些基因组合起来可以有21种变化。