层孔虫（Stromatoporoids）是一类古老的海生无脊椎动物，生存于寒武纪至白垩纪，在志留纪及泥盆纪最为繁盛，常形成礁体，石炭纪至三叠纪无化石记录，中生代仅有少数代表，现已完全灭绝。于1826年首次被命名和描述。曾被认为是藻类、有孔虫、海绵、古杯、水螅、苔藓虫等，现在被视为多孔动物门下的一纲。它们是重要的指相化石，可以藉其判断该地层过去的沉积环境。

层孔虫化石的地理分布甚广，在世界各地志留纪、泥盆纪的碳酸盐沉积地层中几乎都有它们的代表。中国的层孔虫化石很多，常见的属包括拉贝希层孔虫（Labechia）和方格层孔虫（Clathrodictyon）等。珠穆朗玛峰的侏罗纪中发现有准放射层孔虫（Actinostromina）等。在日本则多产于侏罗纪的鸟巢石灰岩上。

其化石为粒状或纤维状，仅发现由碳酸钙组成之块状或层状群体之骨骼化石，未发现动物体。骨骼由石灰质组成，外形变化很大，有半球状、块状、分枝状、薄层状、圆柱状等，最小直径仅数毫米，最大则可达数米以上，由同心层状排列的钙质细层和与之垂直的支柱构成，常相互垂直，形如网格。细层平直、弯曲或褶皱，支柱限于细层之间或穿过细层，有时细层及支柱发育不完整而形成不规则的网格状。细层及支柱均是坚实的或穿有细孔。此外，内部还有厚层、虫室、假虫管等构造。层孔虫的微细构造在分类上十分重要，现已划分出14种类型。有的层孔虫外形为圆柱状，中央具有空心的轴管，管内可具横板，管的周围被细层和支柱或泡沫状组织所围绕，如常见于泥盆纪的双孔层孔虫（Amphipora）。硬件表面常有呈放射状排列的星状沟及刺、瘤、凹陷等。其本身可形成礁，也可和珊瑚及苔藓虫一起形成礁。

全为海生，群体底栖、固着海底或附在其他物体上生长。通常生活在清澈温暖、盐度适中、阳光充足、水动力较强的浅海中，也有生活在潟湖或礁前较深水域中的。常和珊瑚、藻类等构成生物礁。

Side view of a stromatoporoid showing laminae and pillars; Columbus Limestone (Devonian) of Ohio.

Stromatoporoids in the Devonian Keyser Formation, Pennsylvania.

Densastroma pexisum, a stromatoporoid from the Silurian of Saaremaa Island, Estonia.

Stromatoporoid reef (Cairn Formation, Late Devonian) in Calgary, Alberta, Canada.