克格勃博物馆（立陶宛语：Genocido aukų muziejus）是位于立陶宛首都维尔纽斯旧城的一座博物馆，创建于1992年。博物馆的正式名称是大屠杀受害者博物馆，但由于位于克格勃总部对面，因此被成为克格勃博物馆。博物馆展示苏联统治立陶宛期间对立陶宛人的镇压。

坐标：54°41′17″N 25°16′16″E / 54.68806°N 25.27111°E / 54.68806; 25.27111