六甲断层（英语：Liuchia Fault），位于台南市的活动断层，属于逆移断层，呈北北东转南北走向，由台南市白河区头崎内里的六重溪南岸向南延伸至台南市官田区社子村，长约21公里。

六甲断层在地形上呈现明显的线形，而由钻探结果证实六甲断层的存在，在近地表处为一向东倾斜30度的断层，但此断层可能尚未穿出地表，而断层的形成方式可能是沿着向斜轴部发育的逆移断层。

由野外露头、钻井及定年资料的分析结果，六甲断层的长期垂直滑移速率约为5.5~6.3毫米/年，长期水平滑移速率约为11.0~12.7毫米/年。依据GPS监测结果，1999~2005年间九芎坑断层－木屐寮断层－六甲断层系统间有明显的速度差异，在断层上下盘的速度向量变化量约13 毫米/年；而2003~2005年间六甲断层上下盘的水平位移并未有明显的变化量。由近断层的水平位移剖面结果，1999~2006年间横跨六甲断层的速度场变化显示断层为逆移形式兼具右移分量。

六甲断层确认截切更新世晚期地层，在地下浅部截切全新世地层，暂列为第一类活动断层。