XY性别决定系统是一种普遍存在的性别决定系统。人类，多数哺乳类，部分昆虫 ()，部分的蛇，部分植物 ()都是使用此系统。 在此系统中，一个个体的性别是由一对性染色体决定的。 雌性生物拥有两个相同的性染色体 (XX)，被称为"同染色体性别"。雄性生物拥有两个不同的性染色体(XY)，被称为"异染色体性别"。它们当中的例外有XX雄性（英语：XX_male_syndrome）与XY雌性（英语：XY_Female_syndrome）。