日本吞并琉球指的是1872年至1879年期间大日本帝国废除并吞并琉球国、设置冲绳县的一系列历史事件。明治时代日本政府将此事称为“琉球处分”（日语：琉球処分／りゅうきゅうしょぶん Ryūkyū shobun），其中设置琉球藩为“第一次琉球处分”，设置冲绳县为“第二次琉球处分”。

八瑶湾事件后，1872年2月12日（旧历1月5日），奈良原幸五郎（奈良原繁）、伊地知贞馨向鹿儿岛县报告称琉球王府对此事的处置失当。同年7月5日（旧历5月30日），大藏大辅井上馨建议将“琉球国的版籍收回”。6月2日，正院对此予以承认，以“如此暧昧之事不得不要予以匡正。此之处分应该如何”（如此曖昧の事匡正せざるべからず。之を処分する如何して可ならん）进行下问，此是明治政府第一次使用“处分”一次。作为回应，外务省提出了三条：一，停止与外国的私交；二，将琉球王尚泰列为华族；三，册封尚泰为琉球藩王。

7月26日（旧历6月21日），鹿儿岛县派官员来到琉球，将催促琉球派人去东京庆贺明治维新的命令传达给伊地知贞馨。尚泰王派遣尚健（伊江王子朝直）、向有恒（宜湾亲方朝保）、向维新（喜屋武亲云上朝扶）等人组成庆贺使节团赴日本。8月30日（旧历7月27日）到达鹿儿岛，9月16日（旧历8月14日）到达东京。10月16日（旧历9月14日），明治天皇宣布册封尚泰为琉球藩王，位列华族，将琉球国降格为琉球藩。10月22日（旧历9月20日），赐予尚泰王新货币和纸币三万日圆。

10月30日（旧历9月28日），琉球的外交权被移交日本外务省。11月20日（旧历10月10日），日本政府宣布替琉球偿还的负债20万两。但琉球王府为了维持自己的主体性，拒绝了这个提议，以大藏省为担保人，自东京国立银行低息贷款20万日圆来偿还债务。

1875年5月13日，日本决定派松田道之前往琉球。29日，下达让松田道之废止琉球王府由清朝册封的命令。7月10日到达那霸，将明治政府的书简交付给在首里城内的毛凤来（富川亲方盛奎）、毛有斐（池城亲方安规）、向居谦（浦添亲方朝昭）三位三司官。断绝与清的外交关系遭到尚泰王的断然拒绝，尚泰王派毛有斐和马兼才（与那原亲方良杰）等赴东京交涉。日本不准其请，更剥夺琉球的审判权和警察权，将其划归内务省管辖。尚泰王派遣向德宏（幸地亲方朝常）、林世功（名城里之子亲云上春傍）等赴清朝交涉，又向西方列国驻清和驻日本的公使分别致书要求交涉。在东京的琉球大臣也多次请愿。

1879年1月26日，松田道之再次来到琉球，敦促尚泰王中止与清朝的外交关系，但再度遭到拒绝。3月27日，松田道之第三次来到琉球，此次带来了日本军队300余人、警官160余人强行进入了首里城，宣布废除琉球国的命令。尚泰王闻讯忧惊而病，以尚弼（今归仁王子朝敷）代理事务。向居谦等三司官向松田交涉，遭到拒绝。4月4日，日本在琉球之地设置冲绳县，任命锅岛直彬为冲绳县知事。琉球国自此正式灭亡。

琉球被日本吞并引发清朝与日本的外交纠纷，清朝一直主张恢复琉球王的社稷，是为琉球案。反对日本统治的琉球人纷纷流亡清朝。直到清朝在甲午战争中败于日本，将台湾割让予日本之后，才不再重提琉球案。