中国的国家级畜禽遗传资源保护区，是指国家为保护特定畜禽遗传资源即畜禽及其卵子（蛋）、胚胎、精液、基因物质等遗传材料，在其原产地中心产区划定的特定区域，由农业部根据全国畜禽遗传资源保护和利用规划及国家级畜禽遗传资源保护名录负责建立或者确定，并予以公告。

迄今全国共有22个国家级畜禽遗传资源保护区。