特殊教育学系，是指专门在研究特殊教育领域的相关学系，中华民国最早的特教系为国立彰化师范大学特殊教育学系，成立于1975年（民国64年），从此以后各校有关特殊教育方面的科系才逐渐出现。

全世界各个国家有提供特殊教育学士，硕士或博士学位的大学列表。

有招收学士以上学位的特殊教育相关系所之大专院校有：

本案系指中华民国监察院于2002年对教育部处理菲律宾师范大学特殊教育研究所毕业生“学历查证”及“教师资格检定”不当所提出之纠正案。民国八十年代，台湾国中国小特殊教育师资极为缺乏，当时师资主要来源为师范生及在师大或师院修习教育学分班者。因师资培育尚未多元化，加上师范生享有公费待遇，师大及师院之大学联考录取分数颇高，而教育学分班又名额有限，两者皆不易考取。在此时空背景下，特教领域陆续加入从菲律宾师范大学特殊教育研究所毕业回国之师资。当时，学校可以自办教师甄选，菲律宾师范大学特殊教育研究所毕业回国之师资只要能进入学校取得正式教师资格，可直接从硕士学历起薪。造成外界质疑其师资素质不佳及培育过程不明，教育部又处理有明显疏失，因此由监察院依法提案纠正，除了菲师大以外，持菲律宾学历的特教老师也不少人来自德拉萨大学（英语：De La Salle University）特殊教育研究所。