燃料乙醇（英语：Ethanol fuel），也称乙醇燃料，又称生质酒精，是一种被广泛用于运输业的生物燃料。它和酒精饮料中的乙醇是同一类型的醇类。燃料乙醇由富含糖类物质的农作物酿制产生，可作为添加剂加入汽油中制成混合燃料。燃料乙醇主要供汽车、摩托车等交通工具使用，汽油发动机无需做过多改动就可以直接使用燃料乙醇。当汽油价格较高时，燃料乙醇具有明显的成本优势。但是，大规模使用燃料乙醇导致玉米、甘蔗等农作物供不应求、价格上升。同时在生产燃料乙醇的过程中也会释放出二氧化碳或污染物，因而有损其清洁燃料的称号。

世界运输燃料乙醇生产在2000年和2007年间增长了三倍，从170亿到超过520亿升。从2007年到2008年，乙醇在全球汽油型燃料的使用比例从3.7％上升至5.4％。在2011年的全球燃料乙醇产量达到22.36 BG注（846亿升），其中美国是最大的生产者，拥有13.9 BG（526亿升），占全球产量的62.2％，其次是巴西5.6 BG（211亿升）。乙醇燃料具有“加仑汽油当量（英语：Gasoline gallon equivalent）”（GGE）1.5美制加仑（5.7升），这意味着1.5加仑乙醇产生一加仑汽油的能量。

在乙醇发酵期间，在玉米中的葡萄糖和其它糖类（或在甘蔗或其他作物中）被转换成乙醇和二氧化碳。

像任何发酵反应，发酵并非100％的选择性，其他的副产物例如乙酸，乙二醇和许多其他产品在相当程度上形成，并且在乙醇的净化过程中需要被除去。

乙醇在燃烧过程中与氧发生反应，产生二氧化碳，水和热：

植物浆液被置于蒸汽加压锅中加热至100℃的过程被称为“液化”，在此步骤中，胚乳内的淀粉颗粒被分散开来，淀粉分子也被酶破坏。此后，浆液温度将被降至80-90℃，并被加入α-淀粉酶，然后仍需要继续反应至少30分钟。

在液化过程结束后，浆液将被冷却至大约30℃，并被加入葡萄糖淀粉酶以将淀粉水解为葡萄糖。这一步被称为“糖化”。糖化发生于浆液倒入发酵罐后并贯穿接下来的“发酵”这一步。

通过微生物发酵的糖产生乙醇。微生物发酵将目前仅仅直接作用于糖。植物的两个主要组成部分，淀粉和纤维素，是由糖类组成，并且在原则上还可以发酵转换成糖。目前，只有糖（如蔗糖）和淀粉（如玉米）的部分可以符合经济效益的转换。在纤维素乙醇领域有很多研究活动，把植物的一个组成部分纤维素分解为糖，并随后转化为乙醇。