黑腹果蝇 (学名：) 为生物学研究的重要模式生物。实验上，透过遗传学以及分子生物学的技术，建立带有特定基因型的品系或子代，进行后续的研究，故须追踪子代遗传的染色体是否符合实验设计。为避免染色体重组与逢机遗传等现象影响实验结果，操作上，使用历年来建立的特定品系，借由平衡子染色体 (balancer chromosome) 防止重组染色体生殖细胞生成；并以性状指标精确反映实验果蝇个别带有的染色体。研究者观察果蝇特定的性状指标，无须萃取果蝇组织检验染色体，从外观即可筛选遗传染色体符合设计的子代。

存在于果蝇身体上可辨识的性状，源自于内生性的基因缺失、突变，或外源性嵌入染色体的基因的表现。这些对偶基因 (allele) 会使果蝇在不同发育时期从身体构造呈现和野生型 (wild type) 不同的特征。

利用对偶基因会随染色体遗传给其子代的特性，透过观察性状，可以回推该果蝇带有的对偶基因，进而回溯得知其染色体组成。实验常用已知染色体组成的品系开始实验，由性状观察佐以孟德尔遗传定律，即可由亲代品系基因型的排列组合得知子代的基因型，研究者再依此原理挑选符合预期的果蝇子代进行实验。