第二次马达加斯加战争，亦称第二次马达加斯加远征、第二次法兰西-马尔加什战争(法语: L'Expédition de Madagascar/Campagne de Madagascar)，是一场法国企图封锁并征服马达加斯加岛的军事行动。此战役为继第一次马达加斯加战争之后，且为佛朗哥荷瓦战争的最后部分。

当时法国企图透过签订条约将马达加斯加收为保护国，但是腊纳瓦洛娜三世所拒绝，于是法国决定发动远征行动。

公元1894年12月，一支由雅克·杜申所率领的远征军轰炸并占领马哈赞加。在法军登陆的同时，各地的起义事件接连发生，主要是由国内的奴隶及基督教徒两股势力企图要推翻腊纳瓦洛娜三世所领导的政权。公元1895年5月法国远征军主力登陆马哈赞加，并逐渐往首都安塔那那利佛逼近，伊默里纳王国 首相赖尼莱亚里沃尼企图反抗，但最终被法军炮兵所歼灭。公元1895年9月底，法军开始炮击王宫，造成王宫附近死伤惨重，最后腊纳瓦洛娜三世投降。

公元1896年8月6日，法国国民议会通过占领马达加斯加岛议案，从此马达加斯岛正式沦为法国殖民地。尽管法国成功征服马达加斯加岛，零星反抗势力一直到公元1905年由约瑟夫·西蒙·加利埃尼所平定。腊纳瓦洛娜三世投降后，被流放到阿尔及利亚阿尔及尔直到1917年去世。