秘鲁总督辖区（西班牙语：Virreinato del Perú），是西班牙在美洲的四个总督辖区之一。1533年西班牙征服秘鲁，于1542年成立秘鲁总督辖区，首府利马，统治西属南美洲。1718年从秘鲁总督辖区中划出新格拉纳达总督辖区，首府波哥大；1776年又划出拉普拉塔总督辖区，首府布宜诺斯艾利斯。