玉山国家公园是中华民国第二座国家公园，前身为日治时期成立之新高阿里山国立公园（1937–1945）。1985年4月6日公告计划，1985年4月10日成立管理处，总面积103,121.4公顷，涵盖台湾本岛行政区域包括南投县、嘉义县、高雄市以及花莲县，为台湾陆域面积最大之国家公园。园区位居台湾本岛中央地带，地理位置独特，奇峰兀立，雄伟壮丽，为台湾高山少数仍保存原始风貌之地区。其间包括有台湾第一高峰，海拔3952米之玉山主峰，主峰邻近地区崇山峻岭，溪谷深邃，天然植被随海拔之变化而异，由亚热带、温带以至寒带林相次变化，野生动物遍布，并具有清朝所建历史遗迹八通关古道；因此，全区蕴藏许多珍贵之生态资源及人文史迹。玉山地区早于日治时期，即由台湾总督府设有国立公园委员会，指定为“新高、阿里山国立公园”预定地，1937年12月27日“新高阿里山国立公园”与“大屯国立公园”、“次高太鲁阁国立公园”同时成立，但是三座国立公园因日本战败而废止。战后不久，中华民国政府迁台，开始着手研拟国家公园法规与设立。《国家公园法》经立法院与内政、司法等二个委员会进行联席会议12次审查后，最后于1972年5月宣布三读通过，并提交至总统于同年6月13日公布实施。1979年3月，行政院颁布《台湾地区综合开发计划》，将玉山、南横桧谷等地区指定为国家公园预定地。1983年1月1日，玉山国家公园的区域范围奉行政院于第1806次院会中核定通过后，内政部开始着手邀请专家学者乃就区域内生态及人文资源之野外调查，分别对地理地形、动物、植物、游憩及人文史迹资源委托国立台湾大学及内政部国家公园计划委员会审议，并积极展开区域内资源与土地使用之规划。1985年2月7日，玉山国家公园计划遂经行政院于第1921次院会中核定通过，交由内政部公告实施。同年4月10日，成立管理处，原计划设于塔塔加，因土地问题与台湾大学协商不断，最后才改设于水里，并将办公处所暂时借用于民宅。1992年2月13日，玉山国家公园管理处暨训练中心新建工程正式动工。1995年4月11日，玉山国家公园管理处暨训练中心落成启用，并展开为期二天的典礼活动，结束10年来一直借用民宅做为办公处所之历史。玉山国家公园管理处暨训练中心位于现今水里乡中山路一栋外观呈白色的大楼，依临水里溪，背倚浊水溪，门前伫立一块岩石刻题“玉山国家公园管理处 Yushan National Park”。2012年，在玉山国家公园第三次通盘检讨中公告，将梅山地区之原住民保留地给予划出，园区范围由105,490公顷减至103,121.4公顷。玉山国家公园东起马利加南山、喀西帕南山、玉里山主棱线，南沿新康山、三叉山后沿中央山脉至塔关山、关山，西自梅山村西侧溪谷顺楠溪林道西侧棱线至鹿林山、同富山，北沿东埔村1 邻北侧溪谷至郡大山棱线，再顺哈伊拉漏溪至马利加南山北峰；计划范围内包括玉山群峰、秀姑峦山、大水窟山、塔芬山、云峰、关山及南横公路梅山至垭口段。国家公园面积共103,121.4公顷，行政区包括南投县信义乡24,163.8公顷、嘉义县阿里山乡1,404公顷、高雄市桃源区34,936.9公顷、花莲县卓溪乡42,616.7公顷。农委会林务局南投、嘉义、花莲、屏东四个林区管理处所有之土地占国家公园面积逾91%，剩余面积分别为台大实验林8,328.3公顷及信义乡东埔村1邻的原住民保留地574.8公顷，两者位于园区西北角，共占园区面积8.64%。玉山国家公园区域内共有两处列为生态保护区域，面积为73,622.34公顷，占国家公园总面积71％，含有丰富的动、植物及地形景观资源。特殊天然景致划设为特别景观区者共有九处，包括玉山群峰、秀姑峦山、达芬尖山、塔芬山、云峰、新康山、三叉山、向阳山、关山断崖、南横公路沿线及日治八通关越岭道等地。成立之初，玉山国家公园管理处将清代修筑之八通关古道及其两侧遗址划为史迹保存区，并于园区北部的观高、西北部的塔塔加、中部的梅兰、西南部的天池、南部的梅山以及东部的大分则分别设置游憩区，遂经多次调整后，梅兰、大分等地皆已改划为生态保护区，梅山则自园区划出为原住民保留地，其余仍保持不变。全区依环境资源分为西北园区、南部园区、东部园区、资源核心区等四个区块。位于西北侧，郡大林道以西及楠梓仙溪以北之地区。包括东埔、观高、玉山主峰及楠溪林道等。可藉台21线、台18线以及投60线进入，有观高、塔塔加两处游憩区，并设有塔塔加游客中心及排云登山服务中心。新中横公路沿线的夫妻树、塔塔加为该区景点，东埔温泉便在园区旁。此区另有台湾大学实验林以及中央大学鹿林天文台等学术研究设施。位于西南部，包括三叉山、向阳山、南横三山、梅兰林道及南横公路沿线至关山垭口隧道等地区。园区西侧外有梅山游客服务中心，藉台20线南横公路进入，有天池游憩区，长青祠、桧谷皆在南横沿线。位于东南侧，米亚桑溪与乐乐溪连线以东地区，包括大分、瓦拉米及新康山地区。台30线仅可到达园区边界的山风，园区外有南安游客中心。南安瀑布、山风瀑布、佳心、喀西帕南纪念碑、黄麻溪谷、瓦拉米等多处景点位于此处。位于计划区东北部及中央地带，包括郡大林道以东、郡大溪、中央山脉秀姑峦山至三叉山之间，西以荖浓溪为界、东至米亚桑溪与乐乐溪连接线。本区利用八通关日治越道及登山步道联络各地，出入以登山者为主。全区由海拔300余米的乐乐溪河谷到3,952米的台湾最高峰玉山，地形高而陡峻，3,000米以上地区约占全区面积12.74%，2,000米至3,000米之地区约占54.57%，有39.73%的山坡坡度达46度以上。区域范围横跨台湾两大山脉：玉山山脉主要山地与中央山脉南段山地，辖区内属于台湾百岳的名峰林立，总计共有三十座。其中，属玉山山脉者有十一座，属中央山脉者有十九座。属玉山山脉者注：西峦大山（3081米）地理上虽属玉山山脉，但行政上不隶属玉山国家公园辖区。属中央山脉者河流以八通关及塔塔加鞍部为分水岭，南有荖浓溪、楠梓仙溪、拉库音溪等高屏溪上游之主要支流，高屏溪流域的集水区占国家公园面积39%；北为陈有兰溪、郡大溪及沙里仙溪等浊水溪上游主要支流，占全区20%。发源于中央山脉东侧之乐乐溪及其支流则向东流汇入秀姑峦溪，占全区41%。本区年平均降雨量约3,600毫米左右，全年降雨日数约140日，集中于5月至8月间。本园区除5到8月外，其余各月均下霜；但因风大，除山谷外，其余各地降霜量并不多。雪期始于10月，止于5月，在海拔2,000米以上地区均会下雪，冬季干旱不明显时，3,000米以上地区的积雪可达四个月。新中横公路水里玉山 → {displaystyle rightarrow } 线及嘉义玉山线由西进入国家公园后，于塔塔加交会。另有台20线（南横公路）梅山段至垭口贯穿南部园区，此段长约30公里，另外通往东埔一邻主要联外道路为投60线乡道，台30线则仅由玉里镇通达东部园区之山风。除上述主要道路外，尚有七条林道。林道主要分布于园区之北、西及南侧，供林务单位作森林防火、造林抚育使用。步道方面，以八通关日治越道及南二段为东西及南北骨干，有多条路线可供登山健行者选择，部分路线需先申请才可进入。据初步调查，本园区至少有58种哺乳类，占台湾哺乳类物种数之74％，几乎包含所有台湾中大型哺乳动物，尤其是台湾野山羊、台湾水鹿、台湾黑熊、台湾野猪、山羌、台湾猕猴等为本区常见，乐乐溪流域为目前台湾黑熊族群数量最多之区域。本园区鸟类约有191种，其中23种台湾特有种鸟类皆可在园区发现。本区的爬虫类与两栖类数量较少，爬虫类有蛇类14种，蜥蜴4种，以阿里山龟壳花、梭德氏游蛇及斯文豪氏攀木蜥蜴等数量较多。两栖类共发现有13种，其中有尾类有阿里山山椒鱼及楚南氏山椒鱼2种，均为台湾特有种，为世界山椒鱼分布带之最南界；无尾类有11种，以盘古蟾蜍、莫氏树蛙及褐树蛙为台湾特有种。园区内共纪录有鱼类4科12种，其中有台东间爬岩鳅、高身铲颌鱼、何氏棘魞、台湾石宾、粗首鱲为台湾特有种。园区内昆虫826种，蝴蝶种类达282种，约占全台蝴蝶种类400种的70%，在东埔温泉及塔塔加一带有相当数量。玉山国家公园约87%地区为天然林，在3,600米以上为高山植群，内单子叶植物总计426种、双子叶植物1,497种、裸子植物28种、蕨类植物441种、苔藓植物177种、菌类植物147种，如:玉山杜鹃、玉山圆柏、玉山薄雪草、台湾冷杉等。园区范围早期为邹族与布农族的生活领域，于陈有兰溪流域与乐乐溪流域之瓦拉米、黄麻等遗址附近发现的石器与陶器等史前遗迹与遗物，证明本地的人类活动至少有一千年的历史。目前园区内只有西北角的南投县信义乡东埔村1邻有人口集中的聚落，主要为布农族聚居处，设籍约400人。园区东部的拉库拉库溪流域有布农族旧聚落遗址，为日治后期推行大规模集团移住而遭废置的旧有部落，大致仍维持百年前的规模，是研究东部布农族实质环境的重要地区。此处已发现布农族旧建筑群51处，建筑构造物241处，遗迹成散状分布于海拔600至1,900米间的山棱上。1875年起开辟的八通关古道则是近代留下的开发纪录，除了相关遗迹之外，现也成为登山健行路线之一。