中国科学院上海药物研究所（英语：Shanghai Institute of Materia Medica, Chinese Academy of Sciences），创建于1932年，位于上海市浦东新区张江高科技园区。是中国科学院下属研究机构，主要从事创新药物基础和应用基础研究。上海药物研究所现有中国科学院院士5人，中国工程院院士2人，正高级科技人员119人，副高级科技人员173人。